Ý nghĩa: Cây phát sinh là một sơ đồ hình cây phát sinh với những nhánh từ 1 gốc chung. Các nhánh ấy lại phát sinh những nhánh nhỏ hơn từ những gốc khác nhau và tận cùng bằng 1 nhóm động vật. Kích thước của các nhánh trên cây phát sinh cáng lớn bao nhiêu thì số loài của nhánh đó càng nhiều bấy nhiêu. Các nhóm có nguồn gốc, có vị trí gần nhau thì có quan hệ họ hàng gần với nhau
Tac dụng: qua cây phát sinh thấy được mức độ quan hệ họ hàng của các nhóm động vật với nhau. Thậm chí còn so sánh được nhánh nào có nhiều hoặc ít loại hơn nhánh khác