Màu của mắt là do số lượng protein sắc tố, còn gọi là melanin trong các tế bào của mống mắt quyết định. Mống mắt càng nhiều melanin thì mắt càng sẫm màu. Tuy nhiên thì melanin chỉ đóng góp 50% trong việc tạo nên màu mắt, 50% còn lại là nhờ ánh sáng phản chiếu vào mắt. Mỗi người có số lượng melanin trong mắt khác nhau nên sẽ có nhiều màu mắt khác nhau và màu mắt của mỗi người là độc nhất.