4 điểm khác nhau đặc trưng nhất là:
- Chân ba ba có màng dạng mái chèo còn chân rùa thì có dạng hình trụ.
- Mai rùa cứng hơn mai ba ba vì rùa sống chử yếu trên cạn, cần một vỏ bọc chắc chắn để tự vệ.
- Ba ba dành hầu hết thời gian sống ở cuộc đời ở dưới nước còn loài rùa thì không.
- Rùa có thể rút chân, đầu, đuôi vào mai để tự vệ hoặc ngủ, còn ba ba không thể làm thế.