- Bởi vì nhiều thế lực chống đối vẫn tiếp tục hoạt động ở cả trong Nam lẫn ngoài Bắc, đe dọa an ninh và toàn vẹn lãnh thổ của dân tộc
- Phía Bắc, thế lực Lê Duy Chỉ ( em ruột Lê Chiêu Thống ) lén lút hoạt động ở vùng biên giới Việt - Trung
- Phía Nam, sau thất bại ở Rạch Gầm, Xoài Mút, Nguyễn Ánh cầu viện tự bản Pháp và chiếm lại Nam Định